El aumento del consumo de carne a nivel mundial a traído consigo algunos problemas de contaminación debido a la crianza, transporte y sacrificio de los animales, el cual generan problemas ambientales debido a los olores, consumo de agua y la generación de aguas residuales.
Las aguas residuales de los mataderos varían en la producción de efluentes y su composición debido al tipo de procesamiento como: carne de res, carne de oveja, aves de corral, etc. Las principales fuentes de contaminación son debido a la presencia de sangre, heces, orina, grasas, residuos de alimentos y agua de limpieza contribuyendo en altas cargas orgánicas, nitrógeno total, fosforo, grasas y solidos suspendidos principalmente. El uso de agua varía entre 6 y 36 m3 por tonelada (ganado vivo) el cual depende del tamaño de operación, las alternativas de tratamiento están sujetas a la calidad de agua a cumplir siendo en casos específicos para pequeña o mediana operación la reducción de aceites y grasas como también los sólidos suspendidos en cambio para grandes plantas se requiere la reducción de aceites y grasas, solidos suspendidos, demanda química de oxigeno(DQO) y demanda bioquímica de oxigeno (DBO).
Los efluentes de los mataderos vertidos a cuerpos de agua superficiales o subterráneos generan problemas debido a los compuestos nitrogenados provocando la eutrofización y crecimientos de algas permitiendo que el oxígeno disuelto disminuya generado zonas anoxicas. La característica biodegradable permite al tratamiento biológico ser un opción económica y técnica viable. El tratamiento anaerobio presenta eficiencias entre el 60-90% en la reducción de la demanda bioquímica de oxigeno(DBO) y un menor consumo energético, sin embargo, no permite reducir la concentración de nutrientes (nitrógeno y fosforo) en cambio el tratamiento aerobio presenta eficiencias hasta el 90% con un mayor consumo energético debido a la aireación y permite la reducción de nutrientes bajo las configuraciones anoxicas-oxicas.